La historia de blaze of the gem song of muse se desarrolla en el futuro, alrededor del año 2175. En el año 2020 la humanidad descubrió una fuente ilimitada de energía de increíble poder, la cual fue adecuadamente llamada "Existencia "(Exs) . Debido a ello las armas vivientes conocidas como "Devoradores "(Kuroganes) fueron creadas. Pero con el tiempo los devoradores se rebelaron contra sus creadores y declaran la guerra en contra de la humanidad. En respuesta a ello, los Dioses crean una elite de guerreros de todo el mundo llamada the Ghosts (los fantasmas) para combatir a los devoradores y así da inicio a una gran guerra (la guerra de la existencia la cual se prolongó por 55 años. Finalmente en el año 2075 los ghosts logra derrotar a los devoradores , de ese modo la guerra de la existencia llega a su fin. Cien Años después en una isla llamada Protento, se libra un gran conflicto entre los Ghosts (D.A) y los Devoradores(Nova) los cuales luchan por dominar el poder o controlar a adeptos por su gran manifestación de (Exs ) poder que existe en cualquier entidad biológica,en la ciudad de Protento una chica llamada Maria Rose se ve inmersa en este conflicto por despertar un poder de la Diosa llamado Muse ,pero es salvada por un Adepto llamado Gilbert Kurogane ,con la cual forma una amistad con el fin de derrotar a los devoradores,y evitar que nova domine el mundo será esta la última esperanza de los Ghost.
